باشگاه فوتبال بایرن مونیخ (به آلمانی: Fußball-Club Bayern München) یک باشگاه فوتبال معتبر آلمانی است که در شهر مونیخ، پایتخت ایالت باواریا واقع شده و هر ساله در رقابت‌های بوندس‌لیگا شرکت می‌کند. این باشگاه تاکنون موفق به کسب ۸۳ جام رسمی شده است که شامل ۶۹ جام ملی و ۱۴ جام بین‌المللی می‌باشد. بایرن مونیخ با ۳۳ قهرمانی در بوندس‌لیگا، ۲۰ قهرمانی در جام حذفی آلمان، ۶ قهرمانی در لیگ قهرمانان اروپا و ۲ قهرمانی در سوپرجام اروپا، به عنوان موفق‌ترین و پرافتخارترین باشگاه فوتبال در آلمان و یکی از برترین باشگاه‌های فوتبال در سطح جهانی شناخته می‌شود. در سال ۲۰۲۰، این باشگاه تحت هدایت هانسی فلیک، موفق به کسب شش‌گانه شد.

بایرن مونیخ در سال ۱۹۰۰ میلادی توسط ۱۱ بازیکن فوتبال و به رهبری فرانتس جان تأسیس شد. این باشگاه برای نخستین بار در سال ۱۹۳۲ قهرمانی آلمان را به دست آورد، اما در اولین دوره بوندس‌لیگا که در سال ۱۹۶۳ آغاز شد، به این مسابقات راه نیافت. بهترین دوران تاریخ بایرن به اواسط دهه ۷۰ میلادی برمی‌گردد، زمانی که این تیم تحت کاپیتانی فرانتس بکن‌باوئر موفق به کسب سه قهرمانی متوالی (۱۹۷۴ تا ۱۹۷۶) در لیگ قهرمانان اروپا شد. تا به امروز، بایرن مونیخ یازده بار به فینال لیگ قهرمانان راه یافته و در شش مورد از آن‌ها قهرمان شده است. آخرین قهرمانی این باشگاه در لیگ قهرمانان اروپا به سال ۲۰۲۰ برمی‌گردد. همچنین بایرن موفق به کسب یک قهرمانی در لیگ اروپا، یک قهرمانی در جام برندگان جام اروپا، دو قهرمانی در سوپرجام اروپا، دو قهرمانی در جام باشگاه‌های جهان و دو قهرمانی در جام بین قاره‌ای شده است که این افتخارات، آن را به یکی از موفق‌ترین تیم‌های اروپایی تبدیل کرده است.

رقبای سنتی باشگاه مونیخ ۱۸۶۰ شامل نورنبرگ و بروسیا دورتموند در بوندس‌لیگا و همچنین رئال مادرید، آ.ث. میلان و منچستر یونایتد در سطح اروپا هستند. این رقابت‌ها به دنبال پیروزی‌ها و شکست‌های مکرر این تیم‌ها در برابر بایرن مونیخ شکل گرفته است. از ابتدای سال ۲۰۰۵، بایرن بازی‌های خانگی خود را در ورزشگاه آلیانتس آرنا برگزار می‌کند و پیش از آن به مدت ۳۳ سال در ورزشگاه المپیک مونیخ فعالیت داشت. بایرن مونیخ به عنوان قدرتمندترین باشگاه آلمان از نظر مالی و چهارمین باشگاه ثروتمند اروپا پس از رئال مادرید، بارسلونا و منچستر یونایتد شناخته می‌شود.

علاوه بر فوتبال، باشگاه ورزشی بایرن مونیخ در رشته‌های شطرنج، هندبال، بسکتبال، ژیمناستیک، بولینگ و تنیس روی میز نیز فعالیت دارد و در فوتبال حرفه‌ای بیش از ۱۱۰۰ عضو فعال دارد. بایرن مونیخ تنها باشگاهی است که در یک سال توانسته هم در فوتبال زنان و هم در فوتبال مردان قهرمان بوندس‌لیگا شود.